L'insertion sociale et professionnelle est partout présente sur le territoire, à travers des entreprises comme TRI à Quingey ou l'ESAT d'Ornans. La CCLL soutient et accueille dans ses locaux la Mission Locale, organisme qui accompagne les jeunes dans la recherche d'une orientation professionnelle et d'un emploi.
La CCLL offre également des chantiers ouverts à l'insertion comme celui du Castel Saint-Denis sur la commune de Chassagne-Saint-Denis, avec l'intervention de l'association API 25 depuis de nombreuses années.